Wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 11 lutego 2015 roku dotyczący wydawania postanowień o przedłużeniu terminu zwrotu różnicy podatku VAT w związku z weryfikacją złożonej deklaracji (sygn. akt I FSK 621/14).
W deklaracji VAT-7 za kwiecień 2013 roku Spółka wykazała różnicę podatku VAT do zwrotu. 21 maja 2013 roku rozpoczęła się u niej kontrola podatkowa w zakresie prawidłowości rozliczenia VAT za okres od 1 do 30 kwietnia 2013 roku. Termin zwrotu nadwyżki podatku VAT za kwiecień 2013 roku przypadał na 3 czerwca 2013, a do 29 maja 2013 roku nie były jeszcze znane wyniki kontoli - organ podatkowy postanowieniem z 29 maja 2013 roku przedłużył termin zwrotu VAT, nie podając jednak dokładnych przyczyn przedłużenia tego terminu.
W dniu 12 czerwca 2013 roku dodatkowo urząd kontroli skarbowej wszczął postępowanie kontrolne na podstawie ustawy o kontroli skarbowej i prowadził weryfikację zasadności zwrotu VAT.Spółka zaskarżyła postanowienie Naczelnika US o którym mowa powyżej dotyczące przedłużenia terminu zwrotu VAT. US argumentował, iż przedłużenie terminu na zwrot konieczne było z uwagi na wszczęte przez UKS postępowanie kontrolne.
Sprawa trafiła do NSA. Sąd wskazał, że postanowienie o przedłużeniu terminu zwrotu podatku VAT jest skuteczne do czasu zakończenia weryfikacji rozliczenia podatnika dokonanej w ramach procedury wskazanej w tym postanowieniu. Wraz ze zmianą procedury weryfikacji konieczne jest wydanie kolejnego postanowienia o przedłużeniu terminu zwrotu do czasu zakończenia weryfikacji rozliczenia podatnika w nowej procedurze. Przedłużenie terminu zwrotu podatku następuje więc nie tyle do czasu zakończenia sprawdzania rozliczeń podatnika, ile do czasu zakończenia weryfikacji dokonywanej w ramach danego postępowania.
Zatem postanowienie o przedłużeniu terminu zwrotu różnicy podatku wydane w związku z weryfikacją rozliczenia podatnika w jednym z postępowań wskazanych w art. 87 ust. 2 ustawy o VAT wywiera zatem skutki do czasu zakończenia tego postępowania, a w sytuacji wszczęcia innego postępowania weryfikacyjnego, organ powinien wydać nowe postanowienie o przedłużeniu terminu zwrotu.
Z poważaniem